《神探狄仁杰3》由两个故事组成。

第一个故事《凉州案－－黑衣社》讲述唐代西北大漠之中押运饷银的3000铁甲军都中了邪毒，他们押运的3000万两饷银，也不翼而飞。案情发生，狄公及时赶到，一场破获‘死亡之神’和‘地狱行动’的精彩战斗打响了。最终，真正的匪首小桃和薇儿束手就擒。

　第二个故事《邗沟案》讲述一年之内，江淮盐铁转运使官船在邗沟覆没了十多次，数百万石食盐损折，船毁人亡！武则天急召狄仁杰追查邗沟覆船大案。经过艰苦的调查和推断，所谓的邗沟覆船案，乃是江湖巨恶铁手团纠集官府及绿林各道联手策划的巨大阴谋。他们人为地造成淮北盐荒，独霸淮北盐市，牟取暴利。狄公在卧虎庄会战，识破阴谋，解决盐荒。”

 
《神探狄仁杰3》剧照。

这里面，一定有一个重大的阴谋！

恩师，学生还有一点想向您请教

这点现在还不能确定

一语中的

我有一种隐隐的感觉

真的是你

大人真乃神人也 

您是怎么知道的? 

这里的水很深啊！

总有一天会真像大白的

恩师，果然跟你推断的一样！！

那么我们可以做这样一个假设``````

大人，不好啦！
噢？

这当中定有蹊跷！

原来是这样......

捣扰了

我终于明白了~ 

难道做好人就这么困难吗??????

吃饱了撑的人不少啊！ 

事情应该是这样的

果然和我想的分毫不差！

为了达成其不可告人的目的

我知道的,原比你们想象的还要多